חינוך
בנופי נחמיה קיים מערך חינוך עליו אמונה ועדת חינוך, קיימות מספר מסגרות הנותנות מענה לטווח גילאים רחב.
המעון- המעון פועל ביישוב זה השנה השביעית, עם צוות חם ומסור והנהלה מקצועית. המעון נותן מענה לילדים בגילאי 0 עד 3 בחלוקה ל-3 שנתונים, כאשר לכל קבוצה סדר יום המותאם לה באופן אישי. המעון מפוקח ע"י מחלקת מעונות במועצה ומשרד התמ"ת וניתנת הנחה לאמהות עובדות לפי דרגות משרד התמ"ת. במעון מוגשות ארוחות בוקר וצהריים חמות וטריות המבושלות במעון ע"י המבשלת בו ביום. הילדים במעון נהנים מחצר גלגלים מאתגרת ומוצלת, משחק בארגז חול, מתקן שעשועים חדש, ג'ימבורי, חצר גרוטאות ועוד פעילויות עשירות ומגוונות.
גן- בנופי נחמיה פועלים 3 גנים לפי חלוקה לשכבות גיל.
הגנים הינם משפחתיים מאוד ומנוהלים ע"י צוות מקצועי ומסור כאשר כל שנתון עובד לפי תכנית משלו. בגנים ישנם משחקים, מתקנים וציוד חדש. במשך השבוע הילדים בגנים נהנים מחוגי העשרה (ריתמיקה ותנועה) ובימי ששי מתקיים מפגש עם רב הגן. הגנים פועלים תחת המועצה אזורית שומרון החל מהשעה 7:30 ועד השעה 14:00 בצהריים.
צהרון- מתקיים במבנה הגן, לאחר סיומו ופעיל בימי ראשון עד חמישי החל מ-14:00 ועד ל- 16:00. הצהרון נותן מענה לילדי הישוב בגילאי גן-יסודי. ארוחה חמה המבושלת במעון ע"י המבשלת, מוגשת מדי צהריים חמה וטרייה. גם הצהרון הוא של משרד התמ"ת.
בי"ס יסודי- ילדי הישוב בגילאי א'-ו' נוסעים מדי יום לבית ספר זה שנמצא בכפר תפוח.
בנוסף מתקיימים חוגים בשעות אחר הצהריים, ביניהם חוג ג'ודו , מחול, קרמיקה, ועוד..
בשבתות ובמשך השבוע ישנה פעילות של ילדי היישוב בתנועת הנוער בנ"ע עם מדריכים צעירים שחלקם הם בוגרי הישוב וחלקם מגיעים מחוץ ליישוב.